Анимус 2.0

Анимус 2.0 (англ. Animus 2.0) был модернизированной моделью Анимуса, который был разработан Ассассинами в 2012 году. По словам его разработчика и сопровождающего Ребекка Крейн, ласково прозвавшая машину «Малышкой», заявила, что ее версия машины была намного лучше, чем те, которые использовались в Абстерго. Она начала разрабатывать его с частичных схем, присланных Люси Стилман, шпионкой Ассасинов в Абстерго, а остальные импровизировала.

Анимус 2.0 во многом отличался от Анимуса 1.28 как физически, так и в трехмерной реальности, которую он проецировал. Например, цвет фона последовательности загрузки изменился с ледяного синего на белый, при этом вся область памяти медленно загружалась при каждом обращении к ней.

Внешние свойства Анимуса также сильно изменились: версия 2.0 вернулась к конфигурации стула, предлагая при этом повышенный комфорт для пользователя. Однако из-за этого потребовался катетер в руке пользователя, чтобы получить доступ к генетическим воспоминаниям и связать пользователя с самим Анимусом. Несмотря на эти улучшения, Анимус по-прежнему страдал от отставания программного обеспечения для перевода и не мог предотвратить эффект кровотечения при длительном использовании.
Новая модель Animus допускала удаленное взаимодействие из внешнего источника, которое включало загрузку информационных пакетов, подобных базе данных, для просмотра пользователем. Во время работы Дезмонда Майлса с Ассасинами в 2012 году Шон Гастингс, историк и тактик Ассасинов, широко использовал эту утилиту, предоставляя бесчисленные файлы об исторических личностях и местах.

Анимус 2.03 также использовался в качестве системы жизнеобеспечения для Дезмонда после того, как он впал в кому, несмотря на предупреждение Ребекки, что Анимус никогда не был предназначен для использования таким образом. В это время виртуальный интеллект Клея Качмарека взял на себя роль написания статей для базы данных Animus.